Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK13Q14004 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
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