Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHROOM2Q13796 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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