Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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