Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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