Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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