Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCLQ13371 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms