Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CLN3Q13286 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN3Q13286 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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