Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RIGQ13278 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RIGQ13278 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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