Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM2Q13029 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms