Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCAPQ12770 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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