Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF1Q10570 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
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