Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms