Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms