Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms