Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms