Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms