Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms