Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSME1Q06323 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms