Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms