Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIN1Q05586 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms