Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6Q03468 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ERCC6Q03468 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms