Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms