Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms