Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms