Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms