Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN7AQ01118 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms