Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL1Q00532 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms