Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms