Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD3P84022 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms