Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms