Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB2AP61019 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms