Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCCD1P59942 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms