Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CABP4P57796 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms