Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP4P49662 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP4P49662 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP4P49662 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP4P49662 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP4P49662 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP4P49662 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP4P49662 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms