Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX1P48742 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX1P48742 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX1P48742 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms