Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP5P45974 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP5P45974 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP5P45974 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP5P45974 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP5P45974 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms