Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPOP42166 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPOP42166 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPOP42166 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms