Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms