Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP62P37198 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms