Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG3P32926 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG3P32926 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG3P32926 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG3P32926 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms