Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5AP29375 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms