Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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PTPRMP28827 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRMP28827 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRMP28827 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
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