Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms