Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO1P25800 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO1P25800 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO1P25800 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO1P25800 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO1P25800 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO1P25800 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO1P25800 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO1P25800 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms