Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMA4P25789 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms