Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMA1P25391 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms