Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FGFR3P22607 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms