Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5AP20339 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5AP20339 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5AP20339 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RAB5AP20339 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RAB5AP20339 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RAB5AP20339 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RAB5AP20339 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RAB5AP20339 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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