Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFAP15692 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms