Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHGAP10645 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHGAP10645 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHGAP10645 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHGAP10645 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHGAP10645 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHGAP10645 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHGAP10645 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms